要防治龙眼丛枝病，应及时砍除染病植株，并加强管理，提高植株抗性，并加强对介体昆虫的防控，降低发病率。
1.新建果园个别染病植株及时砍除，带出园外销毁，并全园喷施消毒剂加护树将军，以将病毒剿灭在萌发段，提升植物抗性和免疫正能量，保护其健康成长。并严禁从病区输出苗木和接穗等繁殖材料，防止对无病田带来侵染源。
2.加强栽培管理，龙眼生长期间需保持养分供应充足，增施有机肥以提高植株抗病性，培育健壮树体。轻病树可及时剪除病枝、病穗，带出园外销毁，以缓和病势、延长果树结果年限。
3.丛枝病除嫁接传播外，还主要通过荔枝蝽象和龙眼角颊木虱对健康植株造成侵染。需加强对介体昆虫的防控，可有效减少园间丛枝病侵染源，降低对健康植株造成为害。