目前国内外报道的橄榄果实采后病害，全部都是侵染性的，主要是由具潜伏侵染特性的病原真菌引起的，也有一些是田间染病后带入贮藏期间的。主要有：
1.橄榄曲霉病
果实采收后的主要病害。一般在贮运过程中容易发生。
症状：初发病时，果实上出现大片浅褐色至褐色不规则病斑，随后长出点状霉层，病果逐渐失水、干燥、收缩，病菌侵染形成黑色点状霉层或侵染形成黄色点状霉层。
2.橄榄疫病
结果后期高温潮湿时易发生。
症状：发病初期，果面出现水渍状病斑，果面局部变褐色；然后，病斑逐渐扩大，多个病斑互相连接，导致果面大部分腐烂。病斑边缘常有霉状物出现，湿度较大时，病斑各处均可见白色霉层。