①选用品种不对路，不适合棚室条件下的栽培。
②品种虽然选对路了，但是播期不适宜，开花结果期正好处于全年的最低温度，棚室内气温低于15℃，虽然能开花，但花药不能散粉或散粉不好，造成落花、落果；或者开花结果期气温高于35℃，花粉容易失去生活力，也容易造成落花落果。
③辣椒、甜椒生长期间特别是开花结果期遇有5天以上的连绵阴雨天气，棚室内光照严重不足；或者定植后为了快速发苗，采取闷棚室多浇水的办法，营养生长过旺，营养生长与生殖生长失调，导致落蕾、落花、落果。
④土壤中严重缺磷、缺钾或缺硼，容易引起花而不实而落蕾、落花，或者肥料过多及施用未充分腐熟的有机肥，造成烧根，也容易引起落花、落果。
⑤辣椒、甜椒生长期间水分供应不均，不是水分过多，就是供不上水，非常容易造成落花、落果。
⑥病虫危害也是引起落花落果的原因之一，特别是近年来病毒病危害青椒生产及辣椒、甜椒制种而造成的大面积落花落果的现象正日趋严重。