玉米瘤黑粉病近年来发生的较多，穗部发病时失去食用、饲用价值，所以防治玉米瘤黑粉病是很关键的工作，应及早做好防治工作。具体的防治方法如下：
玉米整个生育期内，地上部各幼嫩部位都可能发生瘤黑粉病。病部呈瘤状，瘤的大小因发病部位的不同而异，叶片上的瘤较小，果穗或茎节上的瘤常可达拳头大小。瘤未成熟时为一团白色柔嫩组织，外被一层薄膜，成熟后瘤内全部变为黑粉（病菌厚垣孢子），薄膜干裂后黑粉散出。
病菌以厚垣孢子在土壤、病残体及堆肥、厩肥中越冬，以土壤传病为主，种子也能带菌。厚垣孢子随风传到植株上产生病菌后可重复侵染。高温高湿、生长柔嫩、干旱、长期连作、偏施氮肥、虫害、暴风雨造成伤口等因素均易导致发病。非硬粒型品种及果穗苞叶厚、长、紧密的品种抗病性较差。
防治玉米瘤黑粉病，应采取以下措施：
选用抗病品种；每公斤种子用20%三唑酮乳油40毫升拌种；适时深耕，减少初侵染源；增施钾肥，有机肥应充分腐熟，防止带菌；及时防治玉米螟等害虫，减少伤口；高温高湿或干旱天气多时，可喷施1：1：120的波尔多液预防；抢在病瘤薄膜破裂前及早割除后带出田外深埋或焚烧，并将伤口抹上稀泥浆；清洁田园，减少病残株和落叶，重病田实行3年以上轮作。