主要在于花序不同，琼花是木绣球的一个变种，和木绣球相比，花序中间多了一些带花蕊的可孕小花。琼花是伞形花序，木绣球是球状花序。木绣球颜色只有白绿两种，琼花花冠白色，花大如盘。
琼花与木绣球区别
一、花序不同
琼花是木绣球的一个变种，是同一种属，但它们的花序是有很大不同的，琼花的花序是聚伞状，一圈小白花围着中间星星点点的小花。而木绣球则和绣球花比较像，花序球形，有很多密密麻麻的小花组成的球状。
二、花蕊不同
琼花和木绣球最大的区别就是，木绣球是没有花蕊的不孕花，而琼花除了边上围着的一圈白花不带花蕊，中间的小花全部是带花蕊的可孕花，到了9-10月份会结出红色的椭圆形小果子。
三、颜色不同
琼花花色洁白如雪，株型优美，4-5月份开花，聚伞花序开于花枝顶端，周边八朵白色不孕小花包围着，中间两性小花淡黄色的星星点点，十分美丽。木绣球花期也在春季4-5月份，花球有上百朵不孕花组成，颜色有白色和绿色两种。