西红柿营养丰富，是夏季人们常吃的主要蔬菜之一。西红柿要高产需要良好的土壤条件和充足的养分供应，如果施肥不当会给西红柿生产带来不利的影响。为了给西红柿提供更全面的营养，建议在全生育期增施微生物菌肥。
微生物菌肥既可做基肥，也可做追肥，由于微生物菌肥中含有大量的有益菌，菌肥施入土壤后，有益微生物迅速在土壤中以几何级数繁衍扩散，以及功能微生物的代谢产物，能改善土壤的理化性状，提高亲水性、吸附性，增强通透性和保水保肥能力，菌肥不仅含有大量固氮、解磷、解钾活性菌，还含有腐殖酸、有机质和多种微量元素，从而可使番茄增产增收，并有提高品质的效果。
微生物菌肥应用在西红柿上具有以下显著功效：
1、能促进番茄植株生长，叶色深绿，苗齐苗壮；
2、可有效预防番茄青皮果、裂果，使西红柿着色更均匀，畸形果少，口感好，肉质厚，耐贮运，商品性好。
3、还能降低茎基腐病、溃疡病、早疫病、晚疫病、灰霉病等番茄常见病害的发病率；
4、能提高番茄的产量，还可提早成熟，增产效果十分明显。