随着我省绿色食品生产的不断发展，对农药提出了更为严格的要求，同时农户在具体筛选农药时也存在着一定的困难。因此，如何做好以肥防病虫的工作是我们所面临的一个亟待解决的问题。
一、增施有机肥料，减少病虫害的发生。
由于有机肥料含有大量的微生物，对土传病害有拮抗作用。如土壤中的蚯蚓可以吞食病菌，抑制了土壤中病原菌的发展，并且还能减少土壤中对作物有害线虫的密度。
二、施用作物专用肥，实现各营养元素间的平衡，提高作物抗性。
作物专用肥是氮、磷、钾肥配合，大量元素、中量元素及微量元素合理配合施用，利于作物的生长发育，植株健壮，可以增强植株的抗病能力，减轻病虫害的侵入。如水稻施硅肥能使表皮细胞硅质化，白菜施钙等能使表皮细胞膜稳定性提高，可以减少向外溢泌营养物质从而减轻病菌侵染，又可防止“干烧心”的发生。
三、种植大麻，忌避孢囊线虫
据试验，大麻对大豆孢囊线虫有忌避作用，可以利用这一特性在播种完大豆后，在垄沟中播种大麻，当麻长到50～60厘米时，切碎10厘米段，铺放于垄体两侧，中耕时直接覆土，这样既有绿肥作用，又能起到防治孢囊线虫的作用。
四、向土壤中施用微生物肥料，拮抗土壤中的病原菌。
土壤微生物种群数量变化的结果是有益菌占优势，病原菌处于劣势时，植株生长健壮，不易感染病害，反之易感染。因此，向土壤中有目的地投放有益微生物，人为调控土壤微生物种群数量，不但有利于当季作物的生长，又能改良土壤，培肥地力。如MB－97生物菌肥是由海洋放线菌MB－97生产而来的，是细黄链霉素的新变种，对大豆重茬、迎茬的主要障碍因素青霉素891及其分泌毒素和镰刀菌F6有极强的拮抗作用，同时该菌肥中还含有一些大豆生长所必需的营养元素，能有效改良大豆根际微生态环境，改善土壤理化性状及微生物结构，促进各养分间的良性协调与综合配伍，最终实现减毒增产、提高品质的目的。2000年试验结果小区增产率为20.1％，示范区增产率为16％。
澳大利亚微生物肥料Sｃ27，可通过释放能抑制多种普通土壤病菌的天然的强力抗生素，有效地帮助植物根系免受病害的侵染，同时Sｃ27还可通过给蚯蚓提供便于消化的微生物与纤维素混合物（作为蚯蚓的食物）而提高蚯蚓的活性。2000年在西瓜上应用Sｃ27的病虫害发生轻，未施用的发病略重，香瓜上应用的结果是在用重茬药剂防治前提下施用Sｃ27示范区生长良好，叶片光洁，无死亡株出现，未施用的叶片上出现斑点，并有死亡株发生。
五、选择适宜叶面肥料对病虫害也有一定的防效
叶面施肥使营养物质从叶部进入体内，直接参与植物的新陈代谢过程与有机物合成过程，比土壤施肥反应更为迅速，叶面施肥能促进养分平衡，增强酶活性，提高肥料利用率的作用。而且有些叶面肥料含有的成份又有利于病虫害的预防作用，这就为矫正植物缺素症状以及对某些病虫害的预防提供了有力措施。如普绿牌绿农素在水稻上施用对稻瘟病的预防有一定的效果，在黄瓜上应用有增强光合作用的效果，表现出叶面增宽，变厚，叶色浓绿，叶片生命延长，产量增加，好瓜率高，同时绿农素中的木鲊液特有的烟焦气味对害虫有驱避作用，影响害虫寄生繁殖，减少害虫的危害，植株健壮。再如黄宁素2号是具有杀菌、抗病毒，药肥相结合的高效绿色药肥，施用该液肥的白菜比不施的增产17.6％。
尽管肥料对病虫害有一定的预防作用，但在施用时绝不能代替农药，它的作用主要在于预防而不是治疗，因此，科学施肥对病虫害来说主要是防大于治。