南瓜斑点病病病原菌为南瓜叶点霉，异名正圆叶点霉，属半知菌亚门真菌。分生孢子器散生或聚生球形至扁球形，黑褐色，具孔口。直径65-140微米：分生孢子椭圆形，有的一端稍狭细，单胞，无色，大小为(5-7)微米X(2-3)微米，成熟时分生孢子自孔口呈卷须状涌出，侵染葫芦科植物。南瓜斑点病还可以由“瓜角斑壳针孢”引起，可能属同名病害而病原不同。病菌以分生孢子器或菌丝体随病残体遗落土中越冬，翌春以分生的高温多湿季节，北方多见于8-9月份。高温多湿的天气是发病的重要条件，地势低洼或株间郁闭通透性差，发病重。
防治措施：1．合理轮作。避免在低洼地种植，种植前应及时清除前茬作物病残体，深翻晒土，配合喷施清园防腐膜800倍液对土壤进行消毒处理；并选用抗病品种，播种前用倍加倍智能因子膜拌种驱避地下病虫，隔离病毒感染，提高种子发芽率。2．加强管理。适时中耕除草，浇水追肥，同时注意改善株间通透性，并在生长期适时喷施智能促花控旺灵抑制主梢旺长，促进花芽分化；在开花前、幼果期、果实膨大期喷施瓜果壮枝王能够增粗瓜蒂及枝叶营养疏导系统，加大营养输送量，促进瓜体快速发育，使瓜形漂亮，汁多味美。3.发病初期及时喷洒70%甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液+75%百菌清可湿性粉剂800倍液、40%多硫悬浮剂600倍液、50%敌菌灵可湿性粉剂400一500倍液、50%扑海因可湿性粉剂1500倍液。注意喷匀喷足，隔10-15天1次，连续防治2-3次。