番荔枝实生苗种植结果迟，且变异多，难以保持原品种的优良特性，故多用嫁接苗。用一年生樟林番荔枝或AP番荔枝实生苗作砧木。樟林番荔枝砧木嫁接的苗木早果丰产，但生长较缓。AP番荔枝砧木（自砧）的苗木生长速度快，树势旺盛，由于营养生长过旺，抑制了正常的生殖生长，结果迟。5-6年进入丰产期，且果树生长年限长。
嫁接时间有春接和秋接。春接在2月下旬至4月上旬。春梢萌芽前最佳。嫁接后苗木成活率高，生长快。7、8月份即可供种植。秋接在8、9月份进行，成活率较低，苗木翌年春季可供种植。
番荔枝嫁接前最好能移床或提前3～5天剪砧，降低砧木的水分含量，能有效提高嫁接成活率。选择健壮无病害、果形端正、品质优良、丰产性能佳的植株作采穗母株。剪取外围及顶端未结果的强壮枝梢，并立即摘除叶片，用湿毛巾包裹备用。
番荔枝嫁接一般采用单芽或双芽切接。砧木高度保留距地面15-20厘米。选择砧木较平滑的一面垂直切下1.5-2厘米，深达木质部，切口背面顶端用刀往上斜削一刀，使砧木顶端形成斜面，能引导树液的流向，避免树液渗浸嫁接部位。选择接穗较平滑的一面下端垂直切下2厘米，深度同砧术，背面下端削成小斜面，然后将接穗插入砧木切口，砧、穗形成层要对齐，并立即用薄膜绑扎。
苗木嫁接十天内不宜淋水。遇雨应搭架盖薄膜，避免雨水淋湿。萌芽后应注意喷药防治病虫害。接穗芽梢长至3-5厘米时应抹除砧木的芽梢，集中养分供应穗芽生长。
樟林番荔枝的实生苗根系粗，新根具肉质性状，毛根较少。AP番荔枝根系多呈毛根状。樟林番荔枝砧木经嫁接成活后，随着苗木的发育生长，根系逐渐发生变化，形状介于两者之间。其优异的园艺性状逐渐呈现。尤其是耐寒性显著提高。笔者的苗场曾经历3天低温轻霜天气，最低温度2-3℃，樟林番荔枝实生苗受冻害死亡近三成，而经嫁接的苗木安然无恙。