盆栽金桔在不同的生长阶段修剪方法是不同的。若是营养生长期，主要是培养主枝，选留副主枝。生长结果期只要保证少量挂果就行，及时将过密的枝条疏剪掉，促使植株旺盛生长。盛果期要很好的控制高度，高度保证在2.5米以下，盆栽的不需太高。衰老期需回缩修剪，剪短枝条，只留主要枝干就行。
一、营养生长期修剪
营养生长期指的是定植后一两年这段时间，这段时间主要是培养主枝，选留副主枝，让侧枝更好的萌发，从而促使株形更加紧凑。这期间若是发现瘦弱枝，小枝，和主枝争夺的养分的枝条都要剪掉。
二、生长结果期修剪
生长结果期要将过密的枝条疏剪掉，让树冠看起来更加紧凑，植株上少量挂果就行。每年都会有2到3次萌发新梢，要适当抹掉争夺主枝营养的芽点，促使主枝生长更旺盛，更好的开花，结果。
三、盛果期修剪
盆栽养护的金桔树达到盛果期之后要很好的控制高度，高度维持在2.5米以下就行，盆栽养护的不需太高。要及时将顶芽摘除掉，还要适当疏剪枝条，促使植株内部更好的通风，透光，保证旺盛生长，从而才可提高整体的产量。
四、衰老期修剪
等盆栽养护的金桔树进入衰老期之后需回缩修剪。将枝条都剪短，保留植株的主要枝干就行，其他弱小的侧枝全部都要剪掉，这样才可增强老枝的萌生能力。
五、注意事项
修剪金桔树的时候一定要选锋利的刀具，且要消毒之后才可用，保证剪口平整，这样伤口才可更快愈合。