大豆生长期遭受涝灾，易造成烂根，严重的甚至死亡。应在排除田间积水后及时采取补救措施，减灾保产。
扶正植株经过水淹和风吹，大豆根系受到损伤，植株容易倒伏，排水后必须及时扶正、培直，并洗去表面的污泥，以利于光合作用的进行。在田间积水时间长的情况下，易出现烂根、死苗，要及时进行查田补栽。
中耕松土排水后土壤板结，通气不良，应及早中耕，以破除板结，同时进行培土，防止倒伏。
增施速效肥经过水淹，土壤养分大量流失，加上大豆根系吸收能力衰弱，及时施肥有利于植株恢复生长和产量提高。在植株恢复生长前，以叶面喷肥为主，每亩用磷酸二氢钾30克加水40公斤喷施。植株恢复生长后再进行根部施肥，一般每亩施尿素5～10公斤，可结合第二遍中耕进行沟施。
防治病虫涝灾过后田间温度高、湿度大，大豆生长衰弱，抗逆性降低，易发生多种病虫害。可用多菌灵、福美双、甲霜灵、�霜・锰锌等药防治大豆根腐病，用吡虫啉防治大豆蚜虫，用溴氰菊酯防治食心虫、豆荚螟。