一、看柱头痕迹。取一粒杂交稻种子认真观察，在谷壳内外夹缝中间，可见一点不很明显的小黑点，即柱头痕迹。
二、看谷壳吻合处。杂交稻种谷壳吻合处差，有的种粒留有裂口；而非杂交稻种子，其吻合处好，无裂口并严密结合。
三、看谷粒形状。杂交稻种子，子粒不整齐，有大小、粗细不一的感觉。而常规稻种子则整齐一致。
四、看谷尖。杂交稻种子谷粒色泽黄亮谷尖多紫色，而非杂交稻种子的谷尖无色。
五、看谷粒腹部。杂交稻种子的腹部可见凹状，似成“V”字形。而常规稻种子的腹部呈直线状。
