所谓黄瓜根系生理性死亡是指黄瓜侧根及毛细根量明显减少，根系木质部变褐或腐烂，明显死亡的根系经过一段时间恢复还能生出侧根，应该警惕黄瓜根系两次明显的生理性死亡。
第一次生理性死亡是在开花后15—20天至第一果实收获时。此期，植株养分开始向生殖生长供应,由于果实截留了部分营养，使得根系不适应这种变化，因而植株侧根及毛细根发生量有所减少，后期管理不当可导致部分根系变褐或腐烂。生产上可以采取如下预防措施：根瓜采收前促根促秧让植株平衡生长，喷施新高脂膜600—800倍液，可调节黄瓜体内营养平衡，多开花，结壮瓜；根瓜及早采摘，以免坠秧；根瓜采收前后加强肥水管理。
第二次生理性死亡约在腰瓜采摘中后期,即植株生长期达100天左右时开始。植株经过前期旺盛结果，此时开始步人生长后期，根系开始逐渐衰退,根量明显减少,上部叶片颜色变浅,龙头伸长速度减慢,茎细弱,植株生长明显减缓。生产上可以采取如下预防措施：喷施新高脂膜800倍液+壮瓜蒂灵，可强化黄瓜生理机能，提高黄瓜膨大活力，防病、防菌，茁壮根系，强瓜健秧。