选择地势较低、土壤肥沃、排灌方便的田块，以无性繁殖育苗，割取母茎，利用母茎节间长枝产生不定根的特性，再易地栽培种植，当菜苗高度达10厘米时，即可移植大田，移栽后及时喷施新高脂膜，能自动形成一层肉眼看不见的高分子保护膜，优化植物吸水、透气、透光质量。屏蔽病虫扑食信号和削弱传播媒介，抵抗和防御自然环境灾害提高移栽成活率。
水芹定植后20天左右，要及时疏密补稀，人工压根，做到根入泥土，使水芹顶端高度一致，有利于以后生长整齐。还应进行中耕除草，以后水芹植株长满大田可不用进行中耕。萌生的新苗已生出新根和放出新叶时，排水搁田1～2天，然后灌浅水3～4厘米，随植株生长，逐步加深水层，使田间水位保持在植株上部3厘米处。但在出现寒霜或气温低于0℃时，要深水护苗，以植株全部没顶为宜，气温回暖时立即排水。这样水芹才可安全越冬，延长上市时间。