黄芩耐旱怕涝，地内积水过多易造成生长不良，重者烂根死亡，所以种植时应选择阳光充足，土层深厚，排水良好的沙质壤土或腐殖质壤土。
种植前施足底肥，深耕细耙，选择抗病性强的优良品种，用新高脂膜进行拌种，可驱避地下病虫，隔离病菌侵染，提高出苗率，播后及时浇水，保持土壤湿润。黄芩苗期生长缓慢，幼苗出土后要及时松土除草，结合松土适当向幼苗周围培土，1年可进行2-3次，根据苗期生长需求合理开沟施肥，施后覆土浇水，为促使根部生长，可剪去花枝，减少养分消耗，喷施药材根大灵，促使根部生长，使主根更粗壮，须根更旺盛，高产优产。