防治南瓜美洲斑潜蝇采用综合防治技术，具体办法如下：
一、农业防治。①与抗虫作物套种美洲斑潜蝇对苦瓜、苋莱和烟草危害较轻，田间可与这些作物套种，能够减轻危害；②选用抗病品种，并对种子进行浸种和种衣剂+新高脂膜拌种处理，能有效灭杀有害病菌，隔离病毒感染，加强呼吸强度，提高种子发芽率。③分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期喷施壮瓜蒂灵，使瓜蒂增粗，强化营养定向输送量，瓜体健康生长。
二、物理防治。利用成虫趋黄色的习性，用黄色黏蝇纸、黄盘、黄板诱杀。
三、化学防治。做好田间监测，掌握准确的防治期，及时用药。常用药剂：1.8％阿维菌素乳油+新高脂膜，在傍晚和早上打药效果好。