造成沙糖桔根系死亡的主要原因：
1、脚腐病发展后向下蔓延至根群。
2、根结线虫为害。由根结线虫侵入须根（吸收根），形成黄褐色或黑褐色根结。
3、土壤长期积水或土壤水位过高，令根群因长期缺氧而窒息腐烂。
4、向根际施下未腐熟的有机肥，有机肥在土壤中继续腐烂所产生的高温引致烧根。
5、或施肥量过大，吸收根在缺水的情况下枯死。
解决方法：
1、认真检查植株树杆近土壤表面的根胫处，有否皮层表面出现腐烂。如果出现上述的情况，则宜用干净的竹片或刀具，将腐烂物刮除干净，用21％腐烂一喷灵（过氧乙酸）250倍液喷病部，然后用70％福·甲硫可湿性粉剂800倍液与干净的园土调成浆状，对病部进行敷合，再用农用薄膜包裹。在包膜中开几个小孔，每隔约7天通过小孔向敷合的坭奖灌1次上述的杀菌药。然后用上述的杀菌药或70％敌克松可湿性粉剂700倍液灌根。
2、如果发现根群出现黑褐色或黑色的象白豆粒大小的根结，则宜用3％米乐尔颗粒剂。每株于树冠滴水线下施80克，施后覆土及灌水。如果植地用水田改良成柑桔果园的，则宜深挖排水沟，保持排水沟水平至土壤表面80厘米以上。
3、如果是因施未腐熟的有机肥所造成则要通过适量树盘灌水甚至把已施下的有机肥部分挖出。减轻根系的负担。可向植株树冠喷施2-3次叶面肥。每隔约10天喷1次。注意：重点将药液喷到叶背上及在阴天或傍晚喷施。