一、建造大屋窖
建造牢固的大屋窖，一次建窖多年使用，多为半地下式房屋结构，墙厚48厘米，墙体为空心，中间填放稻草或麦草，墙面上方留有通气孔，具有可调节的保温保湿性能。大屋窖的大小可根据红芋贮量而定，一般每立方米堆放500公斤红芋为宜。
二、红芋入窖
在红芋入窖前，对窖壁和窖底用石灰水、石灰粉喷撒，消毒灭菌。用于建立的留种田或无病夏薯田的薯块贮藏。入窖前可采用多菌灵(40%)或甲基托布津(70%)或保鲜剂等药物处理薯块，减少黑斑病、软腐病等病源入窖。在起收、运输、贮藏中要尽量减少薯块机械损伤，精选无病、无伤口薯块入窖。一般在“霜降”前后完成收获贮藏。为防止冷冻，当天中午起收，下午入窖。
三、入窖后管理
1、入窖初期即红芋入窖开始的20天左右。此期窖内温度要控制在14-15℃以下，湿度控制在相对湿度90%。如果采用高温处理的，要求在24小时内把窖内温度升至38-40℃，保持4天4夜，随后2-3天内，排温，排湿，温度降至14℃以下，湿度保持在90%，否则，容易造成出芽和坏烂。
2、贮藏中期是指入窖后1个月起到第2年的2月份。外界温度低，冷气容易侵入窖内，窖内薯块呼吸作用减弱，产生的热量少。管理的中心是保温、防寒、防湿。当窖内温度下降到12-13℃，并还有下降趋势时，要加强保暖，关闭所有的通气孔，窖内盖草保温等，使窖内温度维持在11-13℃，相对湿度为85%-90%。
3、贮藏后期开春后气温回升，要以稳定窖温为主直至出窖，一般保持在11-12℃。可在晴天外界气温超过12℃时，开启通气孔散湿，温度低时，通气孔再关闭。