莴苣菌核病多从茎基部发病，开始形成褐色水浸状病斑，逐渐上向茎部，下向根部扩展，病部组织腐烂。在潮湿条件下，表面长白絮状菌丝，并长黑色鼠粪状菌核，病株上部很快萎蔫枯死。一定要早发现，早治疗。
防治方法：
1、农业防治
深中耕使菌核埋入10厘米以下土中。合理施用氮肥，增施磷钾肥。覆膜栽培，带土定植。选用抗病品种，如红叶莴苣、红皮圆叶等。清除病株病叶时，要把病株病叶带出田外，减少菌源，减轻为害。
2、药剂防治
成株期可用40%菌核净可湿性粉剂1000倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂800倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，或50%速克灵可湿性粉剂1500倍液，或50%农利灵可湿性粉剂1500倍液等，7-10天喷1次，连喷3-4次。为防止抗药性的产生，应交替用药。