1、进行3年以上的轮作，水旱轮作更佳。根肿病严重地区最好不使用草甘膦类除草剂除草。苗床地用50%敌克松400倍液进行处理。
2、调节土壤酸碱度，亩用消石灰100-150公斤均匀撒施于土表，通过整地充分拌于土中。
3、加强栽培管理，坚持深沟高厢，及时排除田间积水。
4、药剂灌窝，亩用“金雷多米尔”500倍液、1%石灰液或1%石灰液＋75%百菌清可湿性粉剂1000倍液灌窝，移栽后2-3天灌一次，10天后再灌一次。
5、及时拔除、销毁病株。发现病株，及时拔除，并采取高温煮或晾干后统一烧毁，绝不能将病株留于田中或丢在其他区域，防止病菌更大面积的蔓延。