芹菜为浅根系作物，吸收养分的能力弱，所以对土壤水分和养分要求均较严格。土壤中充分的水分和养分，可以增强叶的同化作用，促进地下根系的发育，从而使地上部分的分蘖增加和叶面积增大，叶数增多。生长过程中缺水、缺肥，往往使厚角组织加厚，薄壁细胞组织破裂，造成空心，降低品质。在整个生长过程中氮肥是最重要的营养物质，它是保证茎叶生长良好的基本条件，氮素不足，显着影响叶的分化。磷素是不可缺少的，尤其是苗期缺磷影响最大，但磷素过高，使叶片细长、纤维增多，降低品质。钾对芹菜的生长后期极为重要，钾不仅对养分的运输有作用，还可使叶柄粗壮充实，有利于提高品质，增加产量。
每形成1000公斤芹菜，需要氮2公斤、五氧化二磷0.93公斤、氧化钾3.88公斤。芹菜生长期比较长，因此要在定植前施足基肥，基肥用腐熟的猪粪2000-2500公斤，捣碎后施田间，然后耕翻入土。土壤表层再施用1000-2000公斤人粪尿耕耙入土，幼苗期增加施用10-15公斤尿素和氯化钾，可以使芹菜获得充足的氮、钾营养。