一是养护根系，减少发病。芸豆根系弱，且再生能力差，一旦根系受伤后，对幼苗长势影响较大。若在育苗基质添加生物菌肥，提高基质内有益菌数量，则可以通过以菌抑菌的作用，有效保护芸豆根系免受病原菌的侵染，减少发病，尤其能预防红根的发生，大大提高了育苗成活率。
二是利于壮苗的培养。采用添加生物菌肥的基质进行芸豆育苗，由于生物菌肥中的有益菌能在芸豆根系产生次生代谢生命物质，进而刺激根系产生内源生长素，不仅具有促根壮根的作用，而且还能调控幼苗长势，促进花芽分化，培育壮苗壮棵。
既然基质内添加生物菌肥对芸豆育苗有利，那么，如何进行添加呢？王立训推荐的办法：芸豆育苗时可选用50穴或70穴的穴盘，基质可选用鲁青牌营养土，一袋50升，一袋可装10—12个穴盘。而生物菌肥可选用激抗菌968、大源生物菌肥或爸爱我生物菌肥，按照1斤菌肥2000穴的用量进行配置。配置时，分两步，第一步把菌肥先与少量的基质混匀，第二步再把已经掺入生物菌肥的基质与剩下的基质进行混匀，其目的是保持菌肥用量均匀一致。搅拌过程中，需添加适量的水分，使基质湿度以手握成团，松手即散为宜，切忌过干过湿，影响菌肥中有益菌的活性。