蚜虫，也叫腻虫、蜜虫，是我国棉花上的主要害虫之一。在棉田为害的棉蚜有苗蚜和伏蚜之分。苗蚜发生在出苗到现蕾以前，适宜偏低温度，气温超过27℃时繁殖受到抑制，虫口迅速下降；7月上旬后至8月中旬常发生的蚜虫称为“伏蚜”。3日平均温度24～28℃，相对湿度55％～85％时，有利“伏蚜”增殖；时晴时雨的天气最适于“伏蚜”繁殖；持续阴雨5～6天，则有显著抑制作用。
一般单作棉田发生早而重，套作棉田则发生较迟。棉株的营养条件对蚜虫的发生有影响，含氮量高的棉株，蚜虫为害严重。此外，棉蚜的天敌能有效控制其为害，当天敌总数与棉蚜数为1：40时，基本可以控制其为害。棉花蚜虫的防治以农业防治和生物控制为主，化学防治为辅。
1、农业防治
（1）间作套种，可以增加天敌的种类和数量，控制蚜虫为害。如棉麦套种；棉花与绿豆、绿肥等间作；插花种植玉米、油菜、高粱等诱集作物。（2）水旱轮作可以减轻棉蚜的发生。有条件的地方实行棉花和水稻轮作。（3）处理越冬寄主，减少早春蚜源。一般在棉苗出土前，清除棉田内外杂草。
2、药剂防治
（1）选用抗蚜包衣的棉种使用抗蚜种衣剂包衣，可有效地防治苗蚜，并且对蚜虫的天敌--瓢虫有保护作用，如果苗期用药不管是吡虫啉还是啶虫眯都对天敌有杀伤作用，提倡棉农选用抗蚜棉种，既省工又能治虫。（2）交替使用农药3%啶虫咪乳油、10%的吡虫啉可湿性粉剂与2.5%的啶尔净（鑫秋种子专用）乳油稀释1500～2000倍，可以延缓蚜虫抗药性的产生。