番茄在生长发育过程中，常因环境条件不适、管理不善，特别是大棚反季节栽培2～4月份时。对番茄生长发育的条件难以保持时，往往会出现某些生理性病果，根据病果特征，确定形成原因，采取合理措施，是搞好防治的关键。
一、主要形成原因
番茄的生理性病果有裂果、畸形果、空洞果、脐腐果等，发生的原因大致有3个方面。
1、苗期夜温过低畸形果的形成，主要是在2～7真叶期也就是番茄第1～3穗花分化期的这个阶段的低夜温、多氮、多湿、幼苗徒长容易使光合产物较多地积累在正在分化的生长点上，从而导致分化多心室的畸形花，以后发育成畸形果。
2、钙、硼等微肥不足在花芽发育、开花及幼果膨大过程中，钙、硼等微肥不足使花器发育不良、果实细胞结合欠佳，加剧果实的病症。
3、点花激素浓度过大为了促进坐果使用的激素，如果浓度过大，促进果实发育的力量就大，在番茄体内光合产物不能很好配合的情况下，轻者出现果实尖顶、大花脐，重者出现开裂。
二、病果症状及其预防措施
1、裂果症状：主要表现果皮出现裂纹。在果实发育后或转色期遇到高温、烈日、干旱、暴雨等不良气候条件时，特别是干旱和肥料不足时，大量施肥浇水后，果皮和果肉生长速度不同步时则出现裂果。另外，浇水过大或暴雨过后导致根系生理障碍及对硼的吸收受阻时也易产生裂果。预防措施：生理防治措施：保证肥水均衡供应，搞好温光调控，避免温度过高；化学防治措施：坐果初期用10%硫酸锌和0.1%硫酸铜溶液喷洒植株和幼果，提高抗热和裂果能力。果实发育后期用27%高脂膜乳剂80～100倍液喷洒果实。
2、畸形果症状：主要表现果实脐部突出或凹陷，果形多棱或盘形。当幼苗遇到低温、干旱或氮肥过多时多出现脐部突出。一般阴雪天气较多和低温年份畸形果较多。预防措施：生理防治措施：调节好光、温、肥、水，满足番茄生长发育的要求，促进花芽正常分化；化学防治措施：喷施0.01%助壮素控制植株徒长，严格掌握醮花时的激素浓度、防止浓度过高。
3、空洞果症状：主要表现果实内部果肉不充实，有空洞形成。坐果前使用激素过量、光照不足或日高温超过35℃以上时间较长，中后期肥料供应不足，浇水过量或不足等原因，均易形成空洞果。预防措施：生理防治措施：搞好光温调节，增加光照，避免35℃以上高温的影响，当高温天气出现时，应及早通风或遮阳降温，及时供应肥水，促进植株健壮生长。增施有机肥，合理施用氮磷钾及微量元素化肥。化学防治措施：正确使用激素，在醮花时应严格掌握激素浓度，并根据温度变化是党增减。
4、脐腐果症状：主要表现果实脐部出现深褐或黑色的病斑。主要是因土壤缺钙或土壤盐分过高、水分供应失调影响钙的吸收造成。预防措施：生理防治措施：合理施用肥水，实行平衡施肥，防止土壤次生盐渍化，尤其是结果期应保证水分均衡供应。化学防治措施：在初花期开始用1%的过磷酸钙加百万分之五的萘乙酸叶面喷施，10～15天1次，连续2～3次。