番茄茎基腐病是一种土传病害，苗期和成株期均可发病，主要危害即将定植的大苗和定植后七八天到第一穗果开花结果时的植株茎基部。
发病初期，茎基部首先变褐，绕茎基部一圈，随后病部失水变细干缩，病部以上叶片变黄。果实膨大期，植株萎蔫下垂枯死，似青枯症状。发病部位出现具有同心轮纹的椭圆形或不规则形褐色病斑，后期病部表面形成黑褐色大小不一的菌核。
结合当地及外地用户的实际操作经验，对于该病的除治，应以药液灌根效果较好，喷雾效果不太理想。可供选择的药剂有以下几种：
①用25%嘧菌酯悬浮剂1500-2000倍液（即每10毫升药液对水15-20公斤）灌根，每株灌药液150毫升左右，一般一次即可。
②用72.2%霜霉威盐酸盐水剂20毫升+99%霉灵可溶性粉剂5克，对水15-20公斤灌根，每株灌配好的药液150毫升。
③68.75%氟菌霜霉威悬浮剂25毫升+30%甲霜霉灵水剂8毫升，对水15-20公斤灌根，用量同上。
如欲喷雾防治，可选用上述药剂对水15公斤喷施，间隔3-5天喷1次，连喷2-3次。