冬季番茄萎蔫原因主要有以下几点。
一是土壤缺水，植株受旱引起萎蔫。可以通过适当灌水解决。
二是低温寡照原因。冬季如遇到连续阴雪寡照天气，植株长势相对较弱，根系活力差，晴天后如果骤然拉棚，棚内光照突然加强，温度上升较快，可能导致水分供应不足，造成植株萎蔫。因此，冬季要采用多种措施保证棚内番茄生长所需温度，如可以在棚室草苫外层加盖薄膜，棚内铺设秸秆等。在遇到低温寡照等恶劣天气时，要及时采用临时增温补光措施，改善低温寡照的不利条件，保证番茄正常生长，在阴雨天气过后或阳光强烈时，棚室覆盖物要逐渐除去，不要骤然全部拉起。
三是植株根系发育不良或受损。冬季番茄定植后，浇水过多，土壤湿度过大，根系下扎浅，或者施肥过多等原因都能导致植株根系发育不良或受损，造成植株根系活力下降，抗寒能力降低，从而导致植株吸收水分和养分功能障碍，最终导致植株萎蔫。因此，越冬番茄定植后，要适当控水，促进根系发育，增强植株抵抗低温等不良环境的能力，同时要适时适量施肥和浇水，在浇水时可适当配合施用含氨基酸等成分的肥料，促进根系发育。
四是植株病害原因。当番茄植株感染某些病害如根结线虫、枯萎病等会造成植株根系病变，植株萎蔫。因此，在种植番茄时要及时防治各类病害，做到早防早治。