药防治玉米锈病应早防早治，力求在零星发病时及时防治，适用药有嘧菌酯、丙环唑、烯唑醇、苯甲·丙环唑、苯甲·嘧菌酯、肟菌·戊唑醇等，可以因地制宜选用。发病重时隔1O天左右一次，连续防治2～3次，控制病害扩展。今后对锈病发生重的田块，玉米大喇叭口期结合综合防治病虫害提早用药预防。
近年来玉米纹枯病发生危害日益严重，发病面积逐年增加，已成为制约玉米生产的主要因素之一。该病主要危害玉米叶鞘，也可危害茎秆，严重时引起果穗受害。发病初期多在基部1～2张叶片的叶鞘上产生暗绿色水渍状病斑，后扩展融合成不规则形或云纹状大病斑。病斑中部灰褐色，边缘深褐色，由下向上蔓延扩展。穗苞叶染病也产生同样的云纹状斑。果穗染病后秃顶，籽粒细扁或变褐腐烂。严重时茎基部变为灰白色，次生根黄褐色或腐烂。多雨、高湿持续时间长时，病部长出稠密的白色菌丝体，菌丝进一步聚集成多个菌丝团，形成小菌核。
纹枯病一般在玉米拔节期开始发生，抽雄期病情发展快，吐丝灌浆期危害重。温度20~30℃，雨日多、雨量大，湿度高，病情发展快。玉米连作、播种过密，施氮过多，发病重。地势低洼、排水不良、土壤湿度大的田块发病重。
药剂防治玉米纹枯病，应在发病初期用药，适用药有井冈霉素、己唑醇、戊唑醇、苯甲·丙环唑、嘧菌酯、噻呋酰胺等。重点对玉米基部喷药，一般间隔7~10天再用药防治一次，以提高防效。