由于温度过高过低，营养生长过旺，机械损伤或感染灰霉病等原因，南瓜幼果会自行萎蔫，这种现象称化瓜。如不及早预防，将影响产量，推迟结果时间，效益降低。应采取综合措施防治：
加强前期肥水管理开花坐果前一般不施肥水；瓜蔓徒长，可用浓度为200~250毫克／千克矮壮素溶液浇灌根部；结1~2个幼瓜时，在封行前及时重施追肥。如瓜蔓生长点部位粗壮上翘、叶色深绿不宜施肥，如叶色淡绿或发黄，则应及时追肥；一般每亩追施浓度为50%的粪水1000~1500千克；这个时期如无雨，应及时浇水，并追施化肥，一般每次亩施硫酸铵10~15千克或尿素7~10千克，或复合肥15~20千克。
进行人工授粉选晴天上午8时前进行，以早晨4~6时授粉最好，如无南瓜雄花，也可用西葫芦花粉代替；授粉以后，摘瓜叶覆盖；南瓜长出3~4片真叶时，用浓度为100~200毫克／千克的乙烯利处理，问隔10~15天再喷1次，直接喷洒瓜苗，促使瓜苗雌花早开，幼瓜早结；或在南瓜花期，用20~25毫克／千克的2,4-D溶液，涂于雌花花柄上，可防止果柄脱落，提高结果率。
绑蔓整枝绑蔓整枝等田间操作要尽量避免机械损伤；压蔓前先理蔓，当蔓0.6米左右时压蔓，以后每隔0.3~0.5米压蔓1次，先后进行3~4次；进入开花结瓜期，在已经有1~2个瓜时，可以选择1个个大、形状好、无伤害的瓜留下，摘去其余的瓜，同时摘除侧蔓，并打顶摘心，打顶时要注意在瓜后留2~3片叶子。
根外追肥幼果生长旺盛期，可用磷酸二氢钾或高效复合肥进行根外追肥。
加强病虫害防治尤其是保护地栽培时，要加强通风换气。
适时采收适时采收已达商品成熟度的果实。