一是全棚消毒。首先要进行土壤的灭菌、消毒。先将室内土壤翻松，然后用喷雾器均匀地把配好的药洒在地面上，然后再稍翻一翻，使耕层土壤都能粘着药液，并用薄膜覆盖地面保持两天，使药液充分发挥杀菌作用。然后将薄膜撤去，打开风口通风2周后使用。其次是棚室空间的灭菌、消毒。可用百菌清烟雾剂等。也可用水剂，但必须对棚室内的墙壁、立柱、地面等喷匀。
二是避免人为传病。首先要保证无病苗进棚，尽量避免外来病菌传入棚中。在栽培过程中，外界各种病原菌不可避免通过各种农具、人工及通风等进入大棚，一般情况下7-10天用药一次。预防用药，量要小，为防止病菌产生抗药性要轮换用药。
三是通过环境进行调控。创造适宜作物生长而不适宜病害发生的环境条件。在大棚的栽培管理过程中特别是在冬春低温季节一定要注意降低棚内湿度。为了防止浇水增加棚内的湿度，应采用起垄栽培，覆盖地膜，膜下浇小水的方式进行浇水。如果地面湿度很大，可在走道上撒些草木灰。
四是对症用药，全棚用药。发现病株后，及时对症打药，如霜霉病可用普力克、烯酰吗啉等药剂喷治；角斑病可用可杀得、DT等喷治，5-7天一次，连喷2-3次，病株附近要重防。喷药要全面，叶的正面和反面都要打上药，地面上、墙壁上、立柱上都要打上药。