小麦收获期常遇雨涝天气，导致穗发芽或籽粒霉变，不仅严重影响产量，而且造成小麦品质、耐贮性及留种质量的下降，给农业生产和农民增收带来损失。其预防方法如下：
一、选择适宜品种根据当地情况选择综合性状好、休眠期长、成熟期早的抗雨高产良种。小麦籽粒在完熟后需经过一段休眠期才能发芽，不同品种休眠期长短不同，短的只有几天，长的有几十天。一般来说白皮小麦休眠期短，红皮小麦休眠期长，水地类型休眠期较短，旱地类型休眠期较长。所以选择休眠期较长的品种，这样可以做到事半功倍。另外应适当选用早熟的品种，以便避过雨季。
二、调整收获期根据当地雨季到来时间，适当早播或晚播，使小麦成熟期尽量避过雨季，也可在小麦成熟前10天喷洒催熟剂促麦黄，促进小麦成熟提早收获，避过雨季。
三、合理调控肥水合理施肥，防止肥料过量尤其是氮肥施用过多造成贪青晚熟。建好配套沟系，确保灌排畅通，降低田间湿度，防止小麦在高温高湿的环境条件下引起穗发芽。
四、严防小麦倒伏小麦倒伏后麦穗处于高温、高湿的小环境条件下，穗发芽会加重发生。生产中应积极采取配方施肥、适当稀植、施用矮壮素等各种措施防止小麦倒伏，降低小麦穗发芽几率。
五、药剂处理小麦黄熟期于雨前均匀喷施青鲜素、多效唑、穗萌抑制剂或穗得安可抑制籽粒发芽。注意药剂处理过的小麦不能留种，以免降低种子发芽率。
六、及时收割碾打晾晒小麦成熟后马上抢收、抢打，尽快晾干入库，未能及时碾打的要提早摞垛，雨天做好防雨管理。
七、收获后防霉变
1、摊晾法将麦粒均匀摊放在空房内，越薄越好，并时常翻动。如摊放较厚，可堆成圆圈，中间放置竹篓通风降湿。
2、机械降温法将湿小麦放在通风透气的凉床上，如没有凉床，可薄摊在地面（厚度不超过30cm），用鼓风机、电风扇、排风扇降温排湿，每3－5小时翻动一次。
3、自然缺氧法选择地势较高的背阴处，先用麦糠或草苫铺垫底部，然后将小麦堆放在上面，用新塑料薄膜覆盖，拉紧薄膜四周并用泥土封盖以隔绝空气，从而抑制麦粒及微生物的呼吸。
4、树叶缺氧法将装有新鲜树叶的有孔装具放入粮堆，粮面用塑料薄膜封严，由于树叶呼吸旺盛，能在短时间内把粮堆里的氧气消耗掉，从而抑制了小麦的呼吸作用和霉菌的繁殖，防止麦粒发热、生芽。
5、盐矾拌合法每100千克湿小麦用食盐1.5-2千克、明矾0.5千克，拌匀后堆放于室内通风处，并用塑料薄膜封严。由于食盐和明矾有吸湿杀菌作用，能较好的防止小麦生芽霉变。
6、喷拌食醋法每500千克小麦喷洒2.5千克食醋，边喷边拌匀，堆好后苫盖塑料薄膜，用土或沙压严周边。
7、拌漂白粉法按500千克小麦1千克漂白粉的比例拌和均匀后堆起，用塑料薄膜密封，可使湿小麦在短期内不发热、不霉变。上述方法短期内可控制小麦质量不发生大的变化，一旦天气转晴要抓紧晾晒，晒干后才能久存。