韭菜枯萎病在夏季高温季节，雨后暴晴后最易发病。发病初期叶片中部或接触地面的叶尖部出现水烫样的症状，严重时所有叶片都呈烫伤状，继而完全枯死。发病后的根株虽可萌生新株，但有时再萌发的韭菜仍然会继续发病。所以，要及时防治，以免造成巨大的损失。
1、合理轮作，定植大田应选择肥沃、有机质较足的田块，定植前应浇透水、施足基肥，每亩施充分腐熟的羊棚灰等农家肥3000公斤、25%复合肥30公斤，并在地表喷施消毒药剂加新高脂膜800倍液对土壤进行消毒处理。
2、加强管理，在养根期间，适当控制水分，避免徒长，及时排涝；热闷雨后要抓紧用井水轻浇快浇，以降低地面温度。同时喷施新高脂膜800倍液形成一层保护膜，防止病菌借气流侵入。并适时喷施壮茎灵，可使植物杆茎粗壮、叶片肥厚、叶色鲜嫩、植株茂盛，天然品味浓。
3、药剂防治，发病初期应根据植保要求用75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液等针对性药剂喷雾防治，每隔5-7天，连喷2-3次；并喷施新高脂膜800倍液增强药效，提高药剂有效成分利用率，巩固防治效果。