12月底1月初是五层膜大棚西瓜的育苗时期，更是大棚西瓜最基础的管理时期。笔者在指导大棚西瓜的生产中，每年都发现程度不同的因育苗的一些环节失误而造成育出的苗子是弱苗、病苗，以至于育苗失败，不得不用别人的剩余苗或重新育苗，直接影响了大棚西瓜的提早上市和丰产丰收。现根据笔者往年发现的问题，提出十方面的注意事项。
一、注意营养土的选择
1.不用5～6年内种过瓜类的土。
2.不用超量使用过含莠去津的除草剂(指玉米苗前后的除草剂)的玉米田的土。
3.不用麦田喷过甲磺隆、绿磺隆除草剂的土。
4.不宜用前茬是花生、大豆等豆科作物的土。因为这样的地块地下害虫多。正确的选择最好是用种过葱、蒜、韭菜、圆葱等的辣茬土，或玉米、高粱、谷子等禾本科作物的土。
二、注意营养土的配比
1.不能掺生粪。
2.不能掺干鸡粪、坑土。
正确的配比为田土与粪6：4。粪一定要用发酵好的或用陈粪，每立方米营养土加腐熟的大粪干20公斤、硫酸钾型氮、磷、钾各15含量的三元素复合肥1.5公斤、50%多菌灵100克。
三、注意做好消毒
1.育苗场地的消毒：老瓜区、老育苗场地消毒尤为重要。具体做法是：每亩苗床用0.2～0.3公斤硫黄、0.05公斤敌敌畏加锯末拌匀，于扣棚后在棚内按东南西北及中间放5个点点燃，关闭通风口熏棚。
2.营养土消毒：每1000公斤营养土用200克40%的福尔马林对水20公斤边倒边喷，喷匀后堆成堆，用薄膜盖严，闷3天，而后散开，散尽药味再装钵。育苗盘内种接穗西瓜苗的河沙也要用开水烫过再播种。
3.种子消毒：防叶枯病、蔓枯病用75%百菌清800～1000倍液浸种2个小时；防病毒病用10%磷酸三钠浸种20分钟；要特别注意防止细菌性果腐病(此病近年来有上升趋势，在苗期主要影响嫁接苗成活，造成接穗腐烂)，用2%双氧水浸种15分钟或55℃温水浸种30分钟(恒温)。上述三种药剂浸种可根据上年的发病情况选一种应用，凡是用药剂浸过的种子必须用清水冲洗干净后再催芽。
4.嫁接用具消毒：嫁接时手指、刀片、竹签都要用75%酒精消毒。
四、注意砧木、接穗的催芽温度
1.南瓜的催芽温度为25℃～28℃，不可太高，高温会造成出苗后子叶扭曲，影响嫁接苗成活质量。
2.葫芦的催芽适温为25℃～30℃，不可超过34℃～35℃。4～5小时34℃～35℃的高温就可使种子出现休眠现象，即使再给予正常温度也不能使种子发芽。
五、注意营养钵下面垫纸，防倒苗时伤根
西瓜育苗床的温度是不均匀的，一般是中间及北侧高，南侧及东西两侧低，苗子大小不一。这就需要在育苗过程中将大小苗倒换位置，以利苗齐。由于瓜苗的主根往往从营养钵底孔扎入地下，倒苗时会造成主根折断。瓜类的根系再生能力弱，这样的苗子往往会形成僵苗。解决的办法是：营养钵下面垫上旧报纸，倒苗时就不会伤根了。
六、嫁接苗也需防连作障碍
嫁接是为了防重茬，但用同一砧木连续嫁接4～5年后也会发生死苗。因枯萎病菌也有葫芦专化型和南瓜专化型，就是说葫芦、南瓜等砧木对枯萎病也不免疫，解决的办法是：每1000个营养钵用1袋恩益碧(NEB)对水浇透再播种，可使根系强大，用有益菌抑制有害菌，从而克服连作障碍。
七、注意砧木、接穗的适宜播种期和嫁接适期
大棚西瓜嫁接育苗普遍采用顶插接，现介绍顶插接应注意的问题：
1.用南瓜做砧木，须提前3天播发芽的南瓜籽，3天后播发芽的西瓜籽，即播南瓜籽的同时给西瓜籽浸种催芽。南瓜第一片真叶露出、西瓜子叶展平真叶刚破心，是嫁接的适宜时期。
2.用葫芦做砧木，提前7～10天播葫芦籽而后播西瓜籽。葫芦苗第一片真叶展开，西瓜苗子叶展平，真叶刚破心时为嫁接的适宜时期。
必须注意的是：南瓜砧木下胚轴髓腔孔隙出现较早，不宜过早播种和过晚嫁接，以免影响嫁接苗成活质量。葫芦砧木下胚轴髓腔孔隙出现较晚，故最迟可于第二片真叶展开时嫁接。
西瓜接穗苗不可过大，过大则叶面蒸腾量大，容易引起失水萎蔫；过小则下胚轴伸长尚未结束，嫁接后下胚轴继续伸长，同时子叶不能充分发育，难以育成健壮的嫁接苗。