1、水稻大棚育苗有利于提早育苗，抢夺早春积温。大棚育苗可比小棚育苗提早5～7天，充分利用了早春积温，秧苗发育时间充足，为培育壮秧奠定了基础。
2、提高土地利用率及秧苗利用率。大棚育苗较小棚土地利用率提高13%，育苗绿色面积比小棚增加20～30%，而且因其空间大、四周高，幼苗长势均匀，无边际废弃苗，成苗率显著提高。
3、大棚容积大，采光面积大，保温性能好，棚内温度均衡，提高了光能利用率。加之便于通风，有助于炼苗，更容易育出壮苗。
4、大棚苗素质普遍好于小棚苗。大棚苗一般比小棚苗叶片多0.5～1.0片，根数多2.5～4.5条，根长多1.1～1.5厘米，干物重高0.4～0.5克。
5、省工省种，大棚育苗有利于苗床管理。大棚空间大，人可入棚操作，减少小棚苗床管理反复揭膜散失温度和用工以及扣膜、压膜的劳动强度。
6、经济效益高。大棚有效、科学地进行后茬综合利用，可显著提高经济效益。