近年来在番茄生产中，各地都有发现“脐腐病”的症状。此症的表现是在茄果膨大期，由于果实脐部向下，见不到太阳的部分颜色变褐，有的干枯，有的腐烂，对产量影响很大，品质更是谈不上了。在分析番茄脐腐病的发生条件时，人们发现施肥不当与“脐腐病”的出现有着明显关系。
国内外的研究已经明确番茄脐腐病是番茄生理缺钙严重所引起的次生症状。番茄缺钙病造成腐烂的特定部位是在果脐部分。由于这里是植物蒸腾作用最弱的部位，而钙在体内的运输主要靠蒸腾拉力，因此钙运输不到脐部造成脐部缺钙最严重。
从目前的施肥现状看，在番茄生产中普遍存在着少施或不施有机肥，而单靠施化肥求增产的偏向，而在化肥施用上，又出现偏施重施氮肥，少施磷钾肥等中微量元素的营养失衡问题，这是造成番茄脐腐病近年来频繁发生的外在原因。
调整施肥、预防“脐腐病”发生，还要谈谈番茄的营养特点：其一，番茄产量高，需肥量大，属于无限生长类型，番茄的果实采收期长，随着采收养分不断携出，需要边采收，边补充养分，才能满足不断开花结果的需要。其二，番茄对钾、钙、镁的需求量比较大，尤其是在果实膨大期。番茄对这几种主要养分元素吸收量的大小排列顺序为钾>钙>氮>磷>镁。正因为番茄有以上的营养需求特点，所以在施肥上应该注意以下几点：
（1）重视苗床施肥做到“胎里富”，最好施用有机肥加化肥。化肥的施用要控氮增加磷肥的比例，尤其磷肥品种以选用普钙或钙镁磷肥为优。
（2）基肥深施，有机肥与无机肥结合，在不施有机肥的情况下，化肥品种不一定选择高浓度复合肥，更不一定选择高塔造粒高氮复合肥，而要选择单质氮肥加普钙磷肥，钾肥用硫酸钾或氯化钾都可。酸性土地区的磷肥选择“钙镁磷肥”为佳。
（3）追肥主要施用氮钾肥，注意肥水结合，追肥次数分第一果膨大期的催果肥；第二、三穗果膨大期的壮果肥。追施3～4次。
（4）进入盛果期后，根系衰弱吸肥能力下降，可以采用根外喷肥的方法，喷施磷酸二氢钾，硝酸钙，硼砂和尿素等成分的水溶液，有利于后期壮株壮果，减少脐腐病的发生。