一、采收黄瓜人工授粉后40天左右，瓜皮变黄即可采收，父母本分开采种，将种瓜从有种部分剖开，扒出种子，量多时放在编制袋内，扎上口袋；量少时放入非铁容器里；挤碎瓜瓤，留适量种液准备发酵。
二、发酵常温下发酵24小时左右，不能被雨水冲淋，忌倒入清水，其间可定期搅动，阴雨天时可根据天气情况决定是否淘洗。
三、淘洗种子发酵后，淘洗是关键，将种子倒在瓷盆或塑料桶内，不久，种子就分成三层：瓜瓤、叶子等杂质浮在上层，可捞出；中层为秕籽和杂质的混合物；饱满种子沉在底部，将上层倒出后，不搓洗清淘，直至种子无粘结块，无其他杂质。
四、晾晒淘选后的种子及时晾晒，将种子摊薄，并定期翻晒，直至晒干。干种子手感扎手，折断种子后不连皮。
五、初选晒干的种子要及时加工。首先，用手不断搓种子，直至种子粒粒分开。其次，用筛子筛，用簸箕簸，清除杂质。
六、精选和包衣种子初选完成后，再用良种精选机精选，选出来的饱满种子，用种衣剂包衣、晾干至含水量8%以下，即可进行种子包装、储存。