根腐病主要危害根部及根颈部，发病初期植株地上部分症状不明显，根系变褐，逐渐腐烂坏死，营养供应受阻，呼吸功能逐渐消失，地上部位开始呈现病状，生长势下降，不能抽生新梢或新梢短，果实个小，叶片小而薄、黄化、早期脱落，发生严重的果树，整体长势萎蔫，叶片变小发黄，无可挽救。发病的多为盛果期大树，一般从发病到整株死亡只有1年左右；同时再赶上连续阴雨天气，积水时间长就会加快整株枯萎、落叶、死亡。
果树根腐病主要分为：圆斑根腐病、紫纹羽病、白绢病、白纹羽和根朽病等五种。主要发生在梨、桃、苹果、杏等果树品种，发病的果树主要发生在老果园、滩地或土质粘重、排水不良的果园或者干旱缺肥、土壤板结、水肥易流失、大小年现象严重以及管理粗放的果园。另外，其它病虫害为害重的果园根腐病发生也相对严重。病菌为土壤习居菌，当根系生长衰弱时，抗病能力下降，病菌乘机侵入引起发病，发病高峰期在春季4-5月和秋季8-9月。
果树根腐的发病原因
1.长期施用大化肥，导致土壤恶化，造成根腐病；
2.使用未腐熟的粪肥，造成烂根死树；
3.管理粗放，负载量大，果树生长势弱，抗病性差，容易感病；
4.前茬栽过李树、杏树或其他苗木之类的土壤，病菌累积多，一旦有机会就极易感病。
果树根腐的防治措施
1.改变施肥习惯。减少大化肥的施用，增施有机肥、菌肥以及中微量元素肥料，合理进行施肥。结合春季和秋季施肥，施用佳园微生物菌剂、硫酸钾钙镁和培微，配施化肥，可有效增加土壤有机质和菌群数，改土养根，全面补充营养，强健树体，提高树体免疫力，减少病害发生。
2.改善施肥方式。施肥方式可以是以树干为中心点向外挖辐射状沟约8-10条，或者是环状沟，根据不同果树毛细根分布的位置深度控制在20-40cm，尽可能与土壤掺混后覆盖。
3.合理负载。及时进行疏花疏果，并且控制合理的负载量，维持营养平衡，保持树势健壮。
4.铲除病原菌。如果地上部分出现黄叶、落叶等明显的现象后，及时挖根进行检查，若发现是根腐病，要及时进行药剂灌根：用富力库2500倍+益微500倍+土佳美300倍+萃丽750倍灌根，10斤水/棵，在根茎部周围挖4-5穴见毛细根（约20厘米）灌根，每七天进行一次，连续进行2-3次。叶面及时喷施萃镁绿耕1000倍+萃丽750倍。
5.可在春季3月或秋季9月份对有根腐病的树挖土晾根3～5天，晾晒期间，避免穴内灌入雨水。
6.疏通排水系统，防止果园积水。
7.挖除后的位置科学补栽幼树。