玉米青枯病主要发生在生长后期，叶先青枯，茎基部3-4节干缩腐烂，根部空心变软，皮层变紫红或褐色，易剥离，严重时病株失水萎蔫枯死。发病率一般在10％-15％，高者可达30％以上。该病主要在玉米生长前期侵染，故防治宜早不宜迟。
一、选用抗病品种。种植抗病品种是一项最经济有效的防治措施。近几年培育的鲁单50、鲁单981、农大3138、豫玉22号等玉米良种，既高产，又抗病，可在生产上推广种植。
二、轮作换茬。在同一地块中连年种植玉米，可造成病原菌在土壤中大量积累，发病会逐年加重。如果与大豆、花生等非寄主作物实行轮作，可显著减轻病害的发生。使用包衣种子种子包衣剂中含有杀菌成分及微量元素，既能抵抗病原菌侵染，又能促进幼苗生长，增强抗病能力。种衣剂用量为种子量的1／40-1／50。
三、施用锌、钾肥。玉米青枯病病菌属弱寄生菌，在玉米中后期生长衰弱时才大量发病。施用锌、钾肥可使玉米健壮生长，能大幅度提高玉米的抗病能力，降低发病率。方法是：玉米幼苗期每1／15公顷用锌肥1.5-2千克、钾肥10-15千克，混合后穴施于玉米茎基部7-10厘米处。
四、灌药水。玉米生长中后期发现零星病株时，可用甲霜灵400倍液或多菌灵500倍液灌根，每株灌药液500毫升，有较好的治疗效果。