番茄栽上后，收入的高低主要看管理是否科学细致，只有在科学管理的基础上为番茄创造最适宜的环境条件，才能取得高产高效益。
晴天要通风。晴天揭开草苫，打扫干净棚膜，提高膜的透光率，当温度升高到30℃时，扒开顶缝通风，通风口大小以通风后温度下降5℃以内为宜，下午降到22℃时，关闭通风口，日落前盖草苫，早晨揭苫前最低不低于12℃。
阴雪天要注意。阴天适当晚揭早盖不通风。下雪时及时清扫雪，中午适当揭苫见光，晚上必须盖苫，草苫外要盖防寒膜。连续阴、雪天后放晴，必须遮花阴，不通风，让棚温缓慢升高，升温过猛，极易造成植株萎蔫。阴、雪天后，易发生病害，要喷药防病，喷药时每桶药内加25克尿素、20克磷酸二氢钾，为番茄补充养分。当遇到阴雪天棚内温度太低时，可在棚里用铁炉子点火升温防冻。
加强肥水管理。当第一穗果核桃大小时，进行第一次追肥浇水，每亩追三元复合肥15-20公斤，以后第二、第三穗果等每一穗果长到核桃大小时都追一次肥，每亩每次追尿素10-15公斤、硫酸钾8-12公斤，一般随水追肥。浇水须选晴天上午进行，中午时打开风口通风降湿，可有效防止病害的发生。低温期膜下暗灌，浇水量要少，防止浇水过多导致地温下降过多，影响番茄的正常生长。
合理整枝。大棚番茄一般采用单秆整枝，只留一个主秆，所有侧枝全部疏除。打侧枝要选晴天上午进行，这样有利于伤口愈合。当第一穗果绿熟(果实长到最大，果顶由绿变白)时，除去第一穗果下的老叶，第二穗果绿熟时，除去第二穗果下的老叶，依次类推。这样有利于通风透光，减少养分无效消耗，防止病害蔓延。越冬茬栽培的等主秆结到6-7穗果后，在果穗上方留2-3片叶摘心，并在秆上开始预留侧枝，当主秆上果实采收完后，如果每一株番茄都产生了侧枝，则在基部选留一个健壮侧枝，把它上面的老枝剪去。第二茬又可结5-6层果实。
保花保果。冬季温度低、光照弱，番茄不容易坐果，因此要进行保花保果。最好在一个花序有3-4朵花开时，用浓度为25-50毫克/公斤的防落素(番茄灵)喷花，喷花时加入0.1%的50%速克灵防治灰霉病。用防落素喷花比用2，4-D点花省工，且不易发生药害，但2，4-D绝不能喷花，否则极易发生药害。
疏花疏果。番茄栽培还要进行疏花疏果，因为一穗花结果过多，则果大小不一，商品性差。大果型品种每穗留果3-4个，中果型品种每穗留果5-6个，第一、第二层可适当少留，防止坠秧。留果一般是“掐头去尾留中间”，也就是第一个果不留，后面的小果、畸形果不留，这样留果大小一致，商品性好。