小麦一些常见病害从苗期开始发生危害，生产上在小麦苗期就应该注意防治病害，如果错过防治适期，春季返青期麦田郁闭，施药困难，防治效果往往很不理想，导致病害很难控制。
(1)小麦纹枯病
小麦纹枯病病菌以菌核或菌丝体在土壤病残体中越冬，在冬前和春季各有一个侵染高峰期。小麦出苗分蘖期病株增加，日均气温在３℃以下时病害停止发展.小麦苗期出现叶片发黄、死苗现象，中后期出现根腐、白穗等现象，其中有很大一部分是因为小麦苗期就感染了病害。
小麦纹枯病的发生与播种密度、秋冬季气温有关。冬前温度高、多雨，有利于侵染，秋苗发病率高。春季雨日多，田间湿度大，有利于病菌扩展蔓延。病害发展快慢、流行程度取决于３～４月份的气温、雨量和雨日。
（2)小麦全蚀病
小麦全蚀病是检疫性病害，病菌以菌丝体在土壤、小麦种子和粪肥中越冬、越夏，在小麦苗期从植株根部、芽鞘等处侵入，成为初侵染源。该病在小麦苗期至成株期均可发生，主要危害小麦根系。小麦发病后，根部和茎基部１～２节变黑，植株矮小，叶片自下而上逐渐发黄，输导组织逐渐坏死，生长受阻、发育不良，抽穗后田间出现成簇白穗或连片白穗。“黑脚”和白穗是该病的典型症状。
(3)小麦根腐病
小麦各生育期均可发生根腐病，可危害植株各部位，表现根部腐烂、叶片出现病斑、茎枯死、穗颈枯死等症状。苗期发病，小麦芽鞘和根部变褐色甚至腐烂。发病轻的植株生长细弱，不久枯死；生长后期发病，病株易拔起，但不见根系腐烂，引起倒伏和形成“白穗”。
以上三种病害易防难治，应以预防为主，发现病株后及时用药治疗。可选用１２．５％禾果利可湿性粉剂２５００～３０００倍液喷雾，或者每亩用20％三唑酮乳油1000倍液或43%戊唑醇悬浮剂20克加水４5公斤顺垄喷雾防治，隔７～１０天再喷一次。喷药应喷匀、喷透，使药液充分浸透根、茎。