7月至8月，气温偏高、雨水多，南瓜绵疫病比较容易发生。绵疫病主要为害近成熟果实、叶和茎蔓。果实染病，先在近地面处现水渍状黄褐色病班，后病部凹陷，其上密生白色绵絮状霉层，最后病部或全果腐烂。叶片染病，病斑黄褐色，后生白霉腐烂。
防治方法：1、定植前施用酵素菌沤制的堆肥或者充分腐熟的有机肥，苗期适时中耕松土，以促发根和保墒，甩蔓后及时盘蔓、压蔓；遇有大暴雨后及时排水。发现病瓜时及时摘除，带出田外深埋或者沤肥，拉秧后注意清洁田园，及时耕翻土地。发病初期喷58%甲霜灵·锰锌水分散粒剂500倍液、50%氟吗·锰锌可湿性粉剂500倍液、69%锰锌·烯酰可湿性粉剂700倍液，间隔6—9天喷药1次，连续防治2—3次。