苹果树落叶后到翌年萌芽前是冬季修剪时期，如果剪锯口保护不利会导致伤口愈合能力差，腐烂病侵染严重，对树体造成伤害。因此，在修剪时应注意剪锯口的保护，并加以利用，主要作法如下：
一、剪锯口的保护：修剪时首先应注意全树较大的剪锯口的数量与位置，尤其是树干上不要存在过多的较大的伤口，否则会对树势造成影响。其次，剪锯口要平滑，不能留有毛边，特别是较大的锯口要用快刀修平，以利于愈合。
伤口的保护方法主要有三种。一是涂抹伤口愈合剂，边剪边涂抹封闭伤口，既可防止水分散失，又可避免腐烂病菌侵染，促进愈合。二是伤口包粘土保护，将较大的伤口用胶体状的软泥糊严，然后再用塑料薄膜包好，防止病虫害侵人，减少伤口水分散失，利于愈合。三是对于主干或大枝上的伤口也可于明年春季进行桥接使上下连接，促进愈合。
二、剪锯口的利用：
1、调整枝条方向：根据枝条的生长空间，适当短截促发剪口下的芽，使其改变原枝条的生长方向，迅速生长；对于背上枝或徒长枝，可通过回缩将其改成斜生枝或新的结果枝组，消弱其营养生长优势，缓和树势，促进生殖生长，提早开花结果。
2、调整结果枝组：对于生长过旺的主枝或枝组在基部多疏枝，多造伤，削弱生长势，减少生长量，来控制枝组生长；在疏除背上、两侧或其他地方的大枝或徒长枝时，如果全部疏除后会形成较大的空间，可以采用留茬疏除。即在被疏除枝的基部留下0．5―2cm枝条，让其基部萌发小的枝条来占据空间。
3、促发萌芽：对于当年生枝和1年生枝可以在壮芽处短截，也可以用刻芽或环割的方法促发萌芽。
4、防发萌芽：当年生枝发芽前在芽后刻伤，可防止该芽萌发；疏枝后不需发枝的剪锯口尽量不留茬；夏、秋剪时当年生枝如过长需疏除，但其下部的枝组上又有短枝或花芽，可环割枝条，冬季回缩到弱枝处，以防其下部萌发壮枝。
5、环割与环剥：对于旺长的枝在7―8月用双刃剪子对其隔5―10cm进行多道环割，促其形成花芽；对于生长过旺的树，可在5月中旬和6月底7月初于树干基部分两次进行环剥，以削弱树势，使其形成花芽，以利结果。