小麦纹枯病是一种以土壤传播为主的真菌病害。随着产量水平的提高，高产品种的推广和大水大肥的麦田管理，其危害日趋严重。
小麦播种以后，发芽时若受到病菌侵染，芽鞘变褐，重则腐烂枯死；起身拔节后病株率明显上升，小麦孕穗抽穗期病情迅速发展，扬花灌浆期病株率达到高峰，病斑扩大，相互连成典型的云纹状花斑，后期侵入茎秆造成烂茎，甚至形成枯白穗，结实少，籽粒秕瘦。
农业防治及时防除杂草，可降低田间湿度，改善田间通风透光条件；实行配方施肥，拔节期追肥，实行氮、钾肥配合追施，可有效提高植株的抗病性，切忌偏施氮肥，以免引起麦苗贪青晚熟，诱发病害加重危害。
药剂防治小麦纹枯病的药剂防治应以种子处理为重点，重病田要辅以早春田间接力喷药。
1.春季防治：要根据调查的病情，及早喷药进行预防，在小麦起身期，若田间病株率为15%~20%时，每亩用12.5%禾果利可湿性粉剂20~30克或15%三唑酮可湿性粉剂50~100克或5%井岗霉素水剂150~200毫升，任选一种加水50~75公斤对小麦植株中下部喷洒，隔7~10天再喷洒一次，连喷2~3次。孕穗期每亩用15%三唑酮可湿性粉剂50~100克兑水60千克喷雾。如果病虫同时发生可采用与防治麦蚜、麦蛛蛛等农药混用，便可达到兼治的目的。
2.如果纹枯病在秋苗期发生早且重，春季雨水偏多，病害有可能大发生时，防治指标应从严掌握，防治时间应适当提前。