小麦腥黑穗病是国内外的重要植物检疫对象。小麦染病后，不仅会造成减产或绝收，而且病粒内的黑粉孢子含有一种带有腥臭味有毒物质，人畜食用后会引起中毒。
小麦腥黑穗病的传播途径是：小麦脱粒时，病粒破裂，黑粉飞散，粘附于种子表面或落入田间土壤，在粪肥中长期存活，传播为害。小麦播种后发芽时，冬孢子从叶鞘侵入并到达生长点，随植株而生长，最后在穗部造成为害，一年至侵染一次。冬孢子只有在小麦芽鞘出土后才能通过伤口侵入，所以麦田地下害虫为害重的地块也会相应的发病较重。还有就是在小麦播种深、播种时温度低时会延长小麦的出土时间，从而也就延长了麦芽与病菌的接触时间，会加重病害发生。
防治小麦腥黑穗病措施有：1.石灰水浸种。用生石灰1千克加清水100千克可浸种50千克。浸种时间因温度而定，气温在35℃左右时可浸一天，30℃左右时看浸1.5天