生殖发育障碍在番茄花芽分化过程中，遇到不良环境条件，导致花器不能授粉、受精或不能完全授粉、受精，是番茄落花落果的主要原因。如温度过高或过低，夜间温度低于15℃，花粉管不能伸长或伸长缓慢；白天温度高于34℃，夜间高于20℃，或白天温度达到40℃的高温持续4小时，则花柱伸长明显高于花药筒，花粉不能散落在柱头上，而使子房萎缩，授粉不良导致落花落果。
管理粗放根系发育不良，整枝不及时；高温徒长，营养物质消耗过多；空气湿度过高或过低，均不利于花粉萌发，引起落花落果。
光照不足番茄喜光，对光照条件反应敏感。光照不足，特别是遇到连续阴天时，光合作用受到抑制，激素分泌减少，碳水化合物合成或供应不足，雌蕊萎缩或花粉活力下降而引起落花落果。
病害影响番茄病害主要有早疫病、灰霉病、叶霉病、绵疫病等。病害发生时不但危害番茄的叶片、茎，也浸染花朵和果实，造成花朵干枯脱落或形成病果。防治方法
一、培育壮苗。育苗期温度保持在白天25℃、夜间15℃，防止秧苗徒长或老化。
二、定植后的温度控制。番茄秧苗定植缓苗后温度保持在白天25℃、夜间15℃，促进花芽分化；结果期温度保持在白天25℃～26℃、夜间15℃～17℃，昼夜地温控制在20℃～23℃。
三、加强肥水管理。干旱要及时浇水，积水要及时排除，均衡供水。小水勤浇，避免大水漫灌，采用配方施肥技术，切忌偏施氮肥，保证充足的营养供应。
四、喷施植物生长调节剂。棚室番茄施用生长激素能保花保果。开花时用番茄灵喷花或蘸花较为方便，且果实不易出现畸形。具体方法：每个花序上有3～4朵花开放时，喷花1次即可，切勿将药液溅到嫩叶上。