病毒病是芹菜上的主要病害，菜农应注意预防。病毒病苗期开始发病，叶片初期呈现浓、淡绿色斑驳或黄色斑块，表现为明显的黄斑花叶，后变为褐色的坏死斑，也可出现边缘明显的黄色或淡绿色环形放射状病斑，严重时心叶扭曲畸形或全株叶片皱缩不长、黄化、矮缩，叶柄扭曲，全株矮化，甚至死亡。
此病在芹菜的全生育期都可发生，以苗期发病受害重。靠蚜虫传播，人工操作时接触也可以传毒。栽培条件差，管理粗放，干旱缺肥、水，蚜虫多则发病重。病毒主要在保护地芹菜和其他宿根寄主上越冬。病毒喜高温干旱的环境，适宜发病的温度范围为15℃-38℃、相对湿度80%以下。
预防措施：1.灭蚜防病。灭蚜是预防病毒病传播的关键环节。从出苗到采收整个生育期间，都要搞好灭蚜工作，苗期灭蚜尤其重要。
2.加强田间栽培管理。适时播种，合理密植，施足有机基肥，加强肥水管理，促进植株健壮，提高抗病能力。农事操作中，接触过病株的手和农具，应用肥皂水冲洗，防止接触传染。保护地使用防虫网覆盖，把昆虫挡在棚外。
3.化学防治。从发病初期开始，选用20%盐酸吗啉胍可湿性粉剂(病毒A)500-600倍液、1.5%植病灵乳剂1000倍液、0.1%的硫酸锌溶液或15%病毒必克可湿性粉剂700-1000倍液喷雾，每隔7-10天喷药1次，连续喷雾防治2-3次。