防治茎腐病，应采取综合防治的办法：
1.选择地下水位较低，排水良好的地作苗圃，容器育苗，必须用无病原菌的土壤配制营养土坚持轮作制度，不在同一块地连续培育同一种苗木。
2.杀死病原菌。茎腐病菌是一种土生病菌，平时在土壤中营腐生生活。育苗前可用枯枝、枯叶、干草均匀撒在苗床上，点火焚烧，可杀死土壤中的病原菌。
3.在高温季节搭荫棚，可降低苗床温度，可使发病率减少85%以上;4.提高幼苗抗病力，及时中耕除草、间苗、追肥使幼苗出土整齐，生长健壮。出苗期开始，每亩苗圃用新高脂膜喷洒幼苗，使幼苗外表形成保护膜，防止病菌侵入。发病后，及时清除病苗，在病苗表面喷施护树将军，以防止蔓延。在苗床上插松枝，或在苗圃上套种农作物或绿肥，干旱时灌水抗旱，对降低发病率也有一定的作用。