“肥是庄稼宝，缺它长不好。”但是盲目施肥，不仅起不到好的作用，反而会影响作物的产量，白白浪费肥料。所以我们在施肥时，必须要根据不同的具体条件下水稻本身对养分的需要和土壤的天然供给量，将不同作用和不同效率的各种肥料适量的施用。
一、根据品种特性合理施肥。不同的水稻品种类型，对氮素肥料的反应是不同的，凡是耐肥性强的品种类型，对氮素的需要量就大，利用氮素的能力也强，在氮素用量多的条件下，不易造成氮的过甚，因而增产潜力大。反之亦然。在同类型的品种间耐肥性也有很大的差异，在确定氮素的施用量的时候，必须考虑品种的耐肥性，合理施用氮肥。
二、根据土壤的天然供给量合理用肥。不同土壤类型其养分含量不同，土壤养分的天然供给不同。土质较轻的沙性土，土温高肥料分解快，肥效高丹保肥力弱，故应该用缓效厩肥、泥肥作底肥，在追肥时应少量多次，防止后期脱肥。红壤、黄壤发育而成的稻田，有的缺磷，这类稻田应增施磷肥，而且在这类稻田中有的酸性过高，还需施适当的石灰以中合酸度补充钙质。
三、根据气候合理施肥。土温、水温适宜时，稻根的呼吸作用旺，根的生长快，吸收力强，需肥量大。温度过低会使根的呼吸作用减弱，微生物的活动也减弱，有效养分相应减少。温度过高会使二氧化碳浓度相应增高，妨碍有氧呼吸作用的进行，对养分的吸收受到影响。
除以上三方面因素外，施肥还需根据耕犁的深度、前作、整地质量、肥料种类和施肥的方法、灌水的方法、土壤养分等条件加于考虑。