一是生长条件突然改变，例如果实膨大期遇到低温，根系的养分水分吸收受阻，或氮肥过量而缺钾；此外番茄要求适宜的温度为白天25℃，夜里15℃，如果低于5℃或高于30℃，特别是夜间高温，就可能使果实发育异常。
二是生长调节剂浓度过高，最好选择一些轻装无毒农药方面的调节剂，比如菜果壮蒂灵代替传统化学调节剂不用担心浓度过大导致空心。
三是花期授粉不好或摘心太早。针对这些情况，防止番茄果实空心异形的主要方法是：平衡施肥和适度灌水、改善棚内光温条件、合理授粉和适时摘心、生长调节剂尽量选择轻装无毒农药里面的物理调节剂。