将钙在植物体内的生理功能及其分布规律和番茄脐腐病发病部位和组织柔软、腐烂之症状特征作一对应分析，就可发现二者的因果关系。番茄是一种喜钙作物，对钙的需要量较多，比单子叶禾本科植物的需钙量要多达10倍以上。根吸收的钙主要是分布在细胞壁的中胶层，其次是细胞质膜的外测。一旦发生缺钙中胶层变软，严重时细胞壁解体，细胞膜的不完整会出现渗漏现象，可让真菌菌丝入侵，植株组织的柔软继而遭受腐烂。
为什么发病部位集中于果实顶部，植株的幼芽和根尖部位呢？这与钙在体内的运输特点有关。首先，钙由根向地上部茎、叶、果的本质部运输，主要是靠蒸腾作用的带动，蒸腾强度的大小，直接关系到钙供应的多少。番茄的新生部位包括顶芽、侧芽、根尖的蒸腾量都小，依靠蒸腾作用供应的钙很少，致使这些部位首先缺钙；至于番茄的肉质果蒸腾作用弱，尤其果实顶部的蒸腾更弱，所以极易发生缺钙现象。
另外在各种营养元素中，钙是韧皮部运输活性最低的一个元素，这一特性使钙在植株体内的再运输和再分配能力很弱，即使老叶和成熟叶有钙的富集，也难以运输到果实和幼叶、根尖、生长点中去。这就会导致脐腐病的必然发生了。