浸种催芽：有机南瓜用100℃热水烫种5秒钟，立即对凉水降温至40℃——45℃，搅拌半小时，然后用清水浸种8——12小时，其间用30℃温水淘洗种子2——3次，除去种子表面的黏液。然后用新高脂膜母液稀释后浸种，浸种后捞出后晾两小时，待有机南瓜种子表面干爽后催芽。催芽时温度保持28℃——30℃，2——3天后，待芽长0.2——0.5厘米时，种子胚根显露，俗称露白，即可播种，一般亩用种量为200克左右。
适时播种：在华北地区，早春有机南瓜育苗在日光温室或阳畦中进行，适宜的播期一般为2月下旬至3月初。常用育苗盘育苗，装盘前，每立方米育苗基质拌40%多菌灵粉2公斤消毒。用清水喷洒育苗基质，使其含水量达70%。用新高脂膜200倍液喷雾基质保墒，可活化表层板结密度，提高出苗率。育苗基质装盘时，杯口预留2厘米深的空间。每育苗杯播1粒发芽的种子，上覆2厘米厚的膨化蛭石，然后用地膜盖严育苗盘。也可采用催芽后的种子直播大田的方式。
苗期管理：有机南瓜播种后，白天温度保持25℃——30℃、夜间18℃，当60%的种子拱土时，撤去地膜，白天温度降到20℃——25℃、夜间12℃——15℃，以防幼苗徒长。待心叶2厘米长时，白天温度保持25℃——28℃、夜间15℃左右。育苗期间每5天喷一次清水。在定植前一周开始加大放风量进行炼苗，提高成活率，幼苗两叶一心时，带育苗基质定植。